三级营养师证丢失后，首先不要慌张，可以通过以下步骤进行补办：

1、联系发证机构：首先你需要联系你原来获得三级营养师证书的发证机构，告诉他们你的证书丢失了，这个机构可能是你参加培训的培训机构，也可能是你通过考试的卫生健康部门或者职业技能鉴定中心。

2、提供相关证明材料：发证机构会要求你提供一些证明材料，以证明你是该证书的合法持有人，这些材料可能包括你的身份证、学历证明、培训证明等，如果你能提供原来的证书复印件或者照片，那么补办过程会更加顺利。

3、填写申请表：发证机构会提供一个补办证书的申请表，你需要按照要求填写，在申请表上，你需要提供你的个人信息，包括姓名、性别、出生日期、联系方式等，你还需要详细说明你的证书丢失的情况。

4、交纳费用：补办证书通常需要交纳一定的费用，这个费用的多少取决于发证机构的规定，费用会在几百元到一千元之间。

5、等待补办：提交了申请表和相关证明材料后，你就只需要等待发证机构处理你的申请了，这个过程可能需要一段时间，具体时间取决于发证机构的工作效率。

6、领取新证书：当你的申请被批准后，你就可以去发证机构领取新的三级营养师证书了，新的证书会有你的个人信息和发证日期，但是原来的证书编号会被保留。

需要注意的是，虽然补办证书的过程可能会比较繁琐，但是这是保护你自己权益的必要步骤，因为只有持有有效的证书，你才能从事相关的工作，如果你的证书丢失后被别人冒用，那么可能会给你带来法律风险，一旦发现证书丢失，你应该尽快补办。

三级营养师证丢失后，你需要联系发证机构，提供相关证明材料，填写申请表，交纳费用，然后等待补办，虽然过程可能会有些繁琐，但是只要按照流程操作，你就可以顺利补办你的证书。