按摩师医师证的办理流程主要分为以下几个步骤：

第一步：申请

按摩师和医师都需要向当地人力资源和社会保障局提出申请，具体需要提交的材料包括个人简历、健康证明等。

第二步：审核

人力资源和社会保障局会对申请人的资质进行审核，主要看申请人是否有相关的医学教育背景，是否通过了相关的职业技能考试。

第三步：培训

符合条件的人力资源和社会保障局会对申请人进行专业的培训，使其具备成为按摩师或医师的专业知识和技能。

第四步：发证

培训完成后，申请人需要参加并通过相应的考核，才能获得按摩师医师证，这通常由人力资源和社会保障局来进行。

第五步：使用

拿到证书后，申请人就可以在自己经营的场所提供按摩服务，并可以在医疗机构从事执业活动。