高级农艺师证的发放机构主要有农业部职业技能鉴定指导中心和各地人力资源和社会保障局，具体到某一地区或某一机构，则需要查看其官方发布的相关文件。

农业部职业技能鉴定指导中心负责全国范围内的职业技能鉴定工作，包括高级农艺师等工种的职业技能鉴定，该中心下设若干分中心，负责本地区的鉴定工作。

各地人力资源和社会保障局则主要负责对当地的农村劳动力进行职业培训和技能考核，包括高级农艺师等工种的职业技能考核，地方人力资源和社会保障局还可能与其他相关部门合作，共同颁发高级农艺师等工种的职业技能证书。

需要注意的是，具体的发证机关可能会因地区、行业和地区政策的不同而有所差异，在获取高级农艺师证之前，建议先查询相关的发证机关信息。