如果您在申请全国外贸单证员证书后不久发现证书已经过期，这将对您的工作和未来的职业发展造成一定的影响，以下是关于如何处理这个问题的一些步骤：

1、检查证书的有效期限：您可以首先检查您的证书有效期是否已满，国际贸易从业资格证书的持证人需要每3年进行一次复审，也就是每年进行一次考试。

2、了解重新申请的流程：如果您的证书有效期还未到期，您可能需要寻找其他的途径来获取新的证书，通常情况下，您可以通过参加培训课程或者参加考试来获得新的证书。

3、准备必要的文件：您需要准备好所有相关的证明材料，包括学历证明、职业资格证书等，这些文件应该在您申请新证书之前准备齐全。

4、办理相关手续：在完成所有的准备工作后，您需要前往当地的海关部门提交申请表，并支付相应的费用，根据不同的地区和具体情况，这个过程可能会有所不同。

5、等待审核结果：提交申请之后，您需要等待相关部门的审批，审批时间一般会在几天到几周之间，具体取决于实际情况。

6、完成新证书的领取：当您的申请被批准后，您就可以领取新的国际贸易从业资格证书了。

对于在中国获得的国际贸易从业资格证书过期的问题，您需要及时采取行动来解决，只要按照上述的步骤操作，相信您一定能顺利地处理好这个问题。