按摩师证和小作坊证主要涵盖了按摩业务的经营和服务范围，从宏观上来说，两者的主要区别在于规模、业态类型以及行业定位。

按摩师证属于专业按摩行业的证件，旨在为从事按摩服务的专业人员提供合法身份证明，保障其权益，主要经营范围包括：进行各种物理治疗服务（如推拿、按摩等）；开展按摩技术咨询、培训等活动；销售按摩用品及配件；与客户签订按摩服务合同等。

小作坊证则是个体工商户在满足相关条件的情况下，可以申请的小型加工企业或服务企业的营业执照，该证主要用于小型手工艺品加工或者家庭手工艺制品生产，主要经营范围包括但不限于：手工制作手工艺品；小型加工食品；个人使用家庭办公设备；出租小型物业等。

按摩师证主要针对的是整个专业的按摩行业，而小作坊证则更偏重于日常的手工艺制品生产，二者虽然都具有一定的经营范围，但具体的业务范围会根据机构大小、性质等因素有所不同。