中医针灸师证发证单位是指在国家中医药管理局注册的，具有颁发中医针灸师资格证书的机构，根据《中华人民共和国中医药法》和《中华人民共和国医师法》的规定，从事中医针灸师职业的人员必须取得相应的资格证书，才能在医疗机构、学校、科研机构等单位从事中医针灸工作。

目前，我国主要的中医针灸师证发证单位有以下几个：

1. 中国中医科学院针灸研究所：该所是我国最早成立的针灸专业研究机构之一，也是全国最大的针灸科研机构之一，该所负责组织和实施全国性的针灸学术活动，以及对中医针灸师进行培训和考核等工作。

2. 国家中医药管理局职业技能鉴定中心：该中心是国家中医药管理局直属事业单位，主要负责中医药职业技能鉴定工作，其中包括中医针灸师职业技能鉴定工作，为符合条件的人员颁发相应的资格证书。

3.各省、市、县级中医药管理部门：各级中医药管理部门负责本行政区域内的中医针灸师管理工作，包括资格审核、考试组织、证书颁发等，各级中医药管理部门还会定期组织相关的培训和考核活动，提高中医针灸师的专业水平和素质。

中医针灸师证发证单位是保障中医针灸行业健康发展的重要力量，只有通过严格的考核和培训，才能够确保中医针灸师具备扎实的专业知识和技能，为广大患者提供优质的中医针灸服务。