丙型肝炎是以肝细胞损伤为主的疾病，肝细胞破坏的机制有两种可能性。

①丙肝病毒直接破坏肝细胞。病毒在复制过程中可能直接损伤肝细胞的细胞器，促使肝细胞膜对转氨酶的通透性增加。

②较多实验证明免疫因素是肝细胞损伤的主要原因，尤其是细胞免疫可能丙肝病毒导致肝细胞损伤的重要因素。

丙肝病毒导致肝细胞死亡的形式有两种，一是坏死，二是凋亡，此外，丙型肝炎患者血汪肿肿瘤坏死因子(TNF)处于高水平状态，这也可介导肝细胞进一步损害。总之，HCV致命肝细胞损伤的机制不是单一因素所为，可能是综合原因导致细胞膜的通透性和生理功能的改变。

丙型肝炎在病理上具有许多特征性改变。

(1)汇管区淋巴细胞聚集，可形成淋巴滤泡；胆管上皮细胞变性，周围有大量淋巴细胞浸润。这样严重的汇管区炎症及胆管损伤是丙型肝炎慢性化的重要标志。

(2)肝窦中炎细胞浸润，但不波及窦周的肝细胞，这是区别于急性乙型肝炎的特点，乙型肝炎病理中常伴有窦周细胞嗜酸变性或坏死。

(3)肝小叶内肝细胞变性、坏死较轻。

(4)窦周及肝细胞间隙纤维化比乙型肝炎更为明显，且出观较早。这可能是它更易发展为肝硬变的原因之一。

(5)肝细胞脂肪变性多见。