"医馆按摩师按摩证"和"按摩师医师证"是两种在医疗机构中用于证明按摩师具备专业资格的证书，这两种证书在申请、使用等方面有着重要的区别。

从颁发机构来看，"医馆按摩师按摩证"是由中国美容美发协会颁发的，主要适用于按摩场所（如医院、美容院等）；而"按摩师医师证"则是由国家卫生健康委员会颁发的，主要用于医疗机构内的按摩师。

从性质上看，"医馆按摩师按摩证"是一种行业认可的职业资格证书，持有者可以在任何一家合法的医馆从事按摩工作；而"按摩师医师证"则属于专业医生的专业资格证书，持有者只能在具有资质的医疗机构内从事按摩服务。

从使用范围来看，"医馆按摩师按摩证"主要适用于按摩场所的工作，包括接待顾客、提供按摩服务等；而"按摩师医师证"则主要应用于医疗机构内的按摩师，他们需要通过考试并获得该证书才能在医疗单位进行专业的按摩服务。

"医馆按摩师按摩证"和"按摩师医师证"都是证明按摩师职业资格的重要证书，但它们颁发的机构、性质、使用范围等方面都有所不同，在选择获取何种证书时，应根据自身的实际情况和需求来做出合理的选择。