南京美术指导师证书主要由江苏省美术家协会主办，证书是由南京市人力资源和社会保障局颁发，其考试方式通常包括理论知识和实践技能两部分。

理论知识部分主要是考核考生对美术基础知识、专业理论和教学理念等的理解和掌握程度，这部分的成绩将直接决定学生能否通过考试。

实践技能部分则考核考生在实际教学中的能力和水平，这部分的成绩将与证书的申请结果直接挂钩。

关于费用方面，南京市人力资源和社会保障局规定，报名参加美术指导师考试的学生，需支付一定的考试费，具体的费用信息，您可以通过南京市人力资源和社会保障局官方网站进行查询，由于不同的学校和地区的具体政策可能会有所不同，建议您在报名前咨询相关部门或者学校的具体规定。