保健按摩师证是否能在医院承认，这主要取决于地方政策和规定，在中国，很多医院都接受正规的保健按摩师进行专业培训，并颁发相关的职业资格证书，中国劳动和社会保障部在2014年发布了《职业技能培训指导目录》（第二版），将保健按摩纳入职业技能培训目录，明确指出具备相关技能的人才能够在医疗、康复、美容等相关行业就业。

在一些地区，由于对保健按摩行业的规范性要求较高，或者由于担心过度依赖按摩服务可能会引发疾病，所以有些地方可能不会认可保健按摩师的执业证书，在这种情况下，考生可以通过参加专门的保健按摩师培训课程来获得证书。

至于证书去哪里考，可以在专业的健康培训机构进行学习，也可以在网上找到相关的认证考试机构进行报名，具体选择哪种方式，需要根据考生的学习能力和需求来进行考虑。

虽然许多医院已经接受保健按摩师的职业资格证书，但具体情况还需要根据各地的规定和政策进行判断，在获取证书的过程中，考生需要注意选择有经验的教师，同时也要注重理论与实践相结合，以确保自己的学习效果。