按摩师二级和三级证书在性质上是一样的，它们都是由专业机构颁发的，用于证明个人具备了相关职业技能和知识，在具体的认证流程、考试内容、申请条件等方面可能会有所不同。

两者在获取方式上可能存在差异，一般而言，只有通过考试并获得相应的资格证书才能成为合格的按摩师，但在一些国家和地区，也有可能允许直接参与实践教学来获取证书。

两者的考试内容也会有所区别，一些证书可能需要考生掌握特定的专业理论知识，而另一些则可能更加注重实践操作技能的考核。

不同级别的证书在使用权限和就业前景上也可能存在一定的差异，一级和二级证书通常具有更高的权威性和认可度，适用于高级别的场所和职位，但其薪资待遇通常也会相对较高；而三级证书则主要用于日常工作中的基础操作。

虽然按摩师二级和三级证书在性质和作用上有一定的差别，但在获取方式、考试内容和使用范围上都大体相同，都需要通过专业的培训和考核才能取得，无论您选择哪个级别的证书，都应该确保自己对相关的知识有深入的理解和掌握，并且有足够的实践经验去应对各种实际的工作场景。