口腔保健师证与医师助理的资格证书在性质上有所不同，医师助理的资格证书主要针对医疗、护理等领域中的专业技术人员，通常需要具备医学知识和技能，以及一定的实践经验。

而口腔保健师证则主要针对口腔健康领域进行的专业人员，通过相关培训和考试后可以获得证书，表明其具备从事口腔健康服务的能力，口腔保健师的主要职责包括预防口腔疾病，提供口腔卫生指导等。

两者虽然都与口腔健康有关，但侧重点不同，医师助理的资格证书更侧重于医疗或护理领域的专业知识和技能，而口腔保健师证更侧重于口腔健康的管理和服务能力。