医师证和按摩师证都是从事医疗、护理等职业所必备的证书，但是它们在性质、作用、颁发机构等方面有所不同。

医师证是由卫生部颁发的专业技术人员资格证书，主要表明持证者具备进行临床医学工作的基本能力，持有医师证的人员可以在医疗机构内从事各类医疗工作的专业技术人员。

而按摩师证则是由中国保健协会颁发的职业技能等级证书，主要表明持证者掌握了按摩的基本知识和技能，持有按摩师证的人员可以在各种公共场所、美容院、按摩店等地从事按摩服务的工作。

医师证和按摩师证虽然都是从事医疗服务行业的证件，但是在性质、作用以及颁发机构上都有所不同，在申请这些证件时，需要根据自己的实际情况选择合适的证件类型。