健康管理师证发证机关是指负责颁发和管理健康管理师证书的政府部门或机构，健康管理师证发证机关主要有以下几个：

1、中国卫生健康委员会(原卫生部):中国卫生健康委员会是国务院组成部门之一，负责全国卫生健康工作的领导和监督，作为国家卫生健康行业主管部门，中国卫生健康委员会负责对健康管理师的培训、考试和发证工作进行统一管理和监督。

2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各省、自治区、直辖市卫生健康委员会在中央卫生健康委员会的领导下，负责本行政区域内的卫生健康工作，各地卫生健康委员会也会参与健康管理师的培训、考试和发证工作，但具体操作和发证权限可能因地区而异。

3、人力资源社会保障部：人力资源社会保障部是中国政府的一个部门，负责制定和实施劳动就业、社会保险、社会福利等方面的政策，虽然人力资源社会保障部不是专门负责健康管理师证书颁发的机构，但在实际操作中，各地人力资源社会保障部门可能会参与健康管理师的培训和发证工作。

4、相关行业协会和培训机构：有一些专门从事健康管理师培训的机构，如中国健康促进会、中国医学科学院健康管理中心等，这些机构会组织培训课程、提供教材和辅导，协助有意愿的人学习健康管理知识并参加考试，虽然这些机构不是直接的发证机关，但它们在健康管理师培训和考试过程中发挥着重要作用。

5、中国职业技能鉴定指导中心：中国职业技能鉴定指导中心是一个国家级的职业技能鉴定机构，负责组织和管理各类职业技能鉴定工作，对于健康管理师这一职业资格认证，中国职业技能鉴定指导中心也会提供相关的鉴定服务和技术支持。

健康管理师证发证机关涉及多个政府部门和机构，包括中国卫生健康委员会、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会、人力资源社会保障部以及相关行业协会和培训机构等，这些机构共同参与健康管理师的培训、考试和发证工作，确保健康管理师的专业素质和能力得到有效认可。