健康管理师证的发证机关是指负责管理和颁发健康管理师证书的政府部门或机构，健康管理师证的发证机关主要由国家卫生健康委员会(原卫生部)和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会共同承担，还有一些行业性的健康管理师培训机构也会颁发健康管理师证书。

国家卫生健康委员会(原卫生部)是全国范围内健康管理的主管部门，负责制定和发布健康管理相关的政策法规、标准和技术规范，对全国的健康管理工作进行指导和监督，国家卫生健康委员会下设多个司局，其中包括卫生监督司、疾控司、医政医管司等，这些司局在健康管理领域具有丰富的经验和专业知识，对于健康管理师的培训、考试和发证工作具有重要的指导作用。

各省、自治区、直辖市卫生健康委员会则是地方层面的健康管理主管部门，负责本行政区域内的健康管理工作，各省、自治区、直辖市卫生健康委员会根据国家卫生健康委员会的政策法规和要求，制定本地区的健康管理政策和措施，组织开展健康管理师的培训和考试工作，并对合格的健康管理师进行发证。

除了国家卫生健康委员会和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会外，还有一些行业性的健康管理师培训机构也会颁发健康管理师证书，这些机构通常是由具有一定规模和影响力的健康企业管理层发起成立的，他们利用自身的资源和优势，为学员提供系统的健康管理知识和技能培训，帮助学员通过考试获得健康管理师证书，这些机构颁发的健康管理师证书在行业内具有一定的认可度，但在国家层面上，其发证机关仍然是国家卫生健康委员会和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会。

健康管理师证的发证机关主要包括国家卫生健康委员会(原卫生部)和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会，这些部门在健康管理领域具有丰富的经验和专业知识，对于健康管理师的培训、考试和发证工作具有重要的指导作用，一些行业性的健康管理师培训机构也会颁发健康管理师证书，但其发证机关仍然是国家卫生健康委员会和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会。