中医针灸师证发证机关是指负责管理和监督中医针灸师职业资格认证的政府部门或机构，中医针灸师证发证机关主要由国家中医药管理局、各省市中医药管理部门和职业技能鉴定中心等组成。

国家中医药管理局是全国中医药行业的主管部门，负责制定中医药行业的发展规划、政策和标准，对中医针灸师的职业资格认证工作进行指导和监督，国家中医药管理局下设的职业技能鉴定中心是中医针灸师证发证的主要机构，负责组织和实施中医针灸师的职业技能鉴定工作。

各省市中医药管理部门在国家中医药管理局的指导下，负责本行政区域内的中医针灸师职业资格认证工作，各级中医药管理部门设有专门的职业技能鉴定所，负责组织中医针灸师的职业技能鉴定考试，并对考试成绩进行审核和发放证书。

中医针灸师证发证机关还包括一些专门从事中医针灸师职业资格认证的社会组织和培训机构，这些组织和机构通过开展各类培训课程、提供咨询服务等方式，为有意向从事中医针灸师工作的人员提供专业指导和培训。

中医针灸师证发证机关是一个涉及多个部门和机构的体系，旨在规范中医针灸师的职业资格认证工作，保障广大患者的用药安全和治疗效果，在实际工作中，各证发证机关要密切配合，共同推进中医针灸师职业资格认证工作的规范化、科学化和信息化发展。