针灸师证是由国家卫生健康委员会主管的职业技能鉴定机构颁发的，根据《中华人民共和国职业分类大典》和《中华人民共和国职业技能标准》，针灸师属于中医药类别的技能人才，颁发针灸师证书的机构应当是具有资质的职业技能鉴定机构。

目前，国内主要的针灸师证书颁发机构有以下几个：

1、国家卫生健康委员会指定的职业技能鉴定机构，这些机构包括中国中医科学院、中国医学科学院针灸研究所、北京中医药大学等知名医疗机构和科研院所，他们拥有丰富的临床经验和专业知识，能够对申请人进行全面的技能评估和考核。

2、各省、市、自治区卫生健康委员会指定的职业技能鉴定机构，这些机构通常设在当地的卫生局或人力资源社会保障局，负责本地区的针灸师证书颁发工作，他们也会对申请人进行技能评估和考核，但可能不如国家级机构那么严格和专业。

3、一些民营培训机构也提供针灸师证书培训课程，并自行颁发证书，这些机构的质量参差不齐，需要考生谨慎选择。

无论选择哪种机构颁发针灸师证书，都需要确保其具备合法资质和权威性，以保证证书的有效性和可信度，考生也需要注重自身的学习和实践能力，通过不断的积累和提高才能成为一名优秀的针灸师。